aboutsummaryrefslogtreecommitdiff
AgeCommit message (Collapse)Author
2018-06-02gnu: r-complexheatmap: Update to 1.18.0.Ricardo Wurmus
* gnu/packages/bioinformatics.scm (r-complexheatmap): Update to 1.18.0.
2018-06-02gnu: r-genomicfiles: Update to 1.16.0.Ricardo Wurmus
* gnu/packages/bioinformatics.scm (r-genomicfiles): Update to 1.16.0.
2018-06-02gnu: r-gage: Update to 2.30.0.Ricardo Wurmus
* gnu/packages/bioinformatics.scm (r-gage): Update to 2.30.0.
2018-06-02gnu: r-keggrest: Update to 1.20.0.Ricardo Wurmus
* gnu/packages/bioinformatics.scm (r-keggrest): Update to 1.20.0.
2018-06-02gnu: r-fastseg: Update to 1.26.0.Ricardo Wurmus
* gnu/packages/bioinformatics.scm (r-fastseg): Update to 1.26.0.
2018-06-02gnu: r-annotationhub: Update to 2.12.0.Ricardo Wurmus
* gnu/packages/bioinformatics.scm (r-annotationhub): Update to 2.12.0.
2018-06-02gnu: r-interactivedisplaybase: Update to 1.18.0.Ricardo Wurmus
* gnu/packages/bioinformatics.scm (r-interactivedisplaybase): Update to 1.18.0.
2018-06-02gnu: r-edaseq: Update to 2.14.0.Ricardo Wurmus
* gnu/packages/bioinformatics.scm (r-edaseq): Update to 2.14.0.
2018-06-02gnu: r-deseq: Update to 1.32.0.Ricardo Wurmus
* gnu/packages/bioinformatics.scm (r-deseq): Update to 1.32.0.
2018-06-02gnu: r-aroma-light: Update to 3.10.0.Ricardo Wurmus
* gnu/packages/bioinformatics.scm (r-aroma-light): Update to 3.10.0.
2018-06-02gnu: r-msnid: Update to 1.14.0.Ricardo Wurmus
* gnu/packages/bioinformatics.scm (r-msnid): Update to 1.14.0.
2018-06-02gnu: r-msnbase: Update to 2.6.1.Ricardo Wurmus
* gnu/packages/bioinformatics.scm (r-msnbase): Update to 2.6.1. [propagated-inputs]: Add r-mass and r-scales.
2018-06-02gnu: r-pcamethods: Update to 1.72.0.Ricardo Wurmus
* gnu/packages/bioinformatics.scm (r-pcamethods): Update to 1.72.0.
2018-06-02gnu: r-mzid: Update to 1.18.0.Ricardo Wurmus
* gnu/packages/bioinformatics.scm (r-mzid): Update to 1.18.0.
2018-06-02gnu: r-vsn: Update to 3.48.1.Ricardo Wurmus
* gnu/packages/bioinformatics.scm (r-vsn): Update to 3.48.1.
2018-06-02gnu: r-affy: Update to 1.58.0.Ricardo Wurmus
* gnu/packages/bioinformatics.scm (r-affy): Update to 1.58.0. [inputs]: Add zlib.
2018-06-02gnu: r-affyio: Update to 1.50.0.Ricardo Wurmus
* gnu/packages/bioinformatics.scm (r-affyio): Update to 1.50.0.
2018-06-02gnu: r-mzr: Update to 2.14.0.Ricardo Wurmus
* gnu/packages/bioinformatics.scm (r-mzr): Update to 2.14.0. [inputs]: Add zlib. [propagated-inputs]: Add r-rhdf5lib.
2018-06-02gnu: r-protgenerics: Update to 1.12.0.Ricardo Wurmus
* gnu/packages/bioinformatics.scm (r-protgenerics): Update to 1.12.0.
2018-06-02gnu: r-sva: Update to 3.28.0.Ricardo Wurmus
* gnu/packages/bioinformatics.scm (r-sva): Update to 3.28.0.
2018-06-02gnu: r-methylkit: Update to 1.6.0.Ricardo Wurmus
* gnu/packages/bioinformatics.scm (r-methylkit): Update to 1.6.0.
2018-06-02gnu: r-copywriter: Update to 2.12.0.Ricardo Wurmus
* gnu/packages/bioinformatics.scm (r-copywriter): Update to 2.12.0.
2018-06-02gnu: r-chipseq: Update to 1.30.0.Ricardo Wurmus
* gnu/packages/bioinformatics.scm (r-chipseq): Update to 1.30.0.
2018-06-02gnu: r-annotationfilter: Update to 1.4.0.Ricardo Wurmus
* gnu/packages/bioinformatics.scm (r-annotationfilter): Update to 1.4.0.
2018-06-02gnu: r-rhdf5: Update to 2.24.0.Ricardo Wurmus
* gnu/packages/bioinformatics.scm (r-rhdf5): Update to 2.24.0. [arguments]: Remove. [propagated-inputs]: Remove r-zlibbioc; add r-rhdf5lib. [inputs]: Remove perl.
2018-06-02gnu: r-tximport: Update to 1.8.0.Ricardo Wurmus
* gnu/packages/bioinformatics.scm (r-tximport): Update to 1.8.0.
2018-06-02gnu: r-mutationalpatterns: Update to 1.6.1.Ricardo Wurmus
* gnu/packages/bioinformatics.scm (r-mutationalpatterns): Update to 1.6.1.
2018-06-02gnu: r-bamsignals: Update to 1.12.0.Ricardo Wurmus
* gnu/packages/bioinformatics.scm (r-bamsignals): Update to 1.12.0.
2018-06-02gnu: r-rhtslib: Update to 1.12.1.Ricardo Wurmus
* gnu/packages/bioinformatics.scm (r-rhtslib): Update to 1.12.1. [native-inputs]: Remove autoconf.
2018-06-02gnu: r-zlibbioc: Update to 1.26.0.Ricardo Wurmus
* gnu/packages/bioinformatics.scm (r-zlibbioc): Update to 1.26.0.
2018-06-02gnu: r-motifrg: Update to 1.24.0.Ricardo Wurmus
* gnu/packages/bioinformatics.scm (r-motifrg): Update to 1.24.0.
2018-06-02gnu: r-seqlogo: Update to 1.46.0.Ricardo Wurmus
* gnu/packages/bioinformatics.scm (r-seqlogo): Update to 1.46.0.
2018-06-02gnu: r-genomation: Update to 1.12.0.Ricardo Wurmus
* gnu/packages/bioinformatics.scm (r-genomation): Update to 1.12.0.
2018-06-02gnu: r-seqpattern: Update to 1.12.0.Ricardo Wurmus
* gnu/packages/bioinformatics.scm (r-seqpattern): Update to 1.12.0.
2018-06-02gnu: r-impute: Update to 1.54.0.Ricardo Wurmus
* gnu/packages/bioinformatics.scm (r-impute): Update to 1.54.0.
2018-06-02gnu: r-bsgenome: Update to 1.48.0.Ricardo Wurmus
* gnu/packages/bioinformatics.scm (r-bsgenome): Update to 1.48.0.
2018-06-02gnu: r-topgo: Update to 2.32.0.Ricardo Wurmus
* gnu/packages/bioinformatics.scm (r-topgo): Update to 2.32.0.
2018-06-02gnu: r-graph: Update to 1.58.0.Ricardo Wurmus
* gnu/packages/bioinformatics.scm (r-graph): Update to 1.58.0.
2018-06-02gnu: r-genomicfeatures: Update to 1.32.0.Ricardo Wurmus
* gnu/packages/bioinformatics.scm (r-genomicfeatures): Update to 1.32.0. [propagated-inputs]: Remove r-rmysql.
2018-06-02gnu: r-rtracklayer: Update to 1.40.2.Ricardo Wurmus
* gnu/packages/bioinformatics.scm (r-rtracklayer): Update to 1.40.2. [native-inputs]: Add pkg-config.
2018-06-02gnu: r-genomicalignments: Update to 1.16.0.Ricardo Wurmus
* gnu/packages/bioinformatics.scm (r-genomicalignments): Update to 1.16.0.
2018-06-02gnu: r-summarizedexperiment: Update to 1.10.1.Ricardo Wurmus
* gnu/packages/bioinformatics.scm (r-summarizedexperiment): Update to 1.10.1.
2018-06-02gnu: r-delayedarray: Update to 0.6.0.Ricardo Wurmus
* gnu/packages/bioinformatics.scm (r-delayedarray): Update to 0.6.0. [propagated-inputs]: Add r-biocparallel.
2018-06-02gnu: r-rsamtools: Update to 1.32.0.Ricardo Wurmus
* gnu/packages/bioinformatics.scm (r-rsamtools): Update to 1.32.0.
2018-06-02gnu: r-biostrings: Update to 2.48.0.Ricardo Wurmus
* gnu/packages/bioinformatics.scm (r-biostrings): Update to 2.48.0.
2018-06-02gnu: r-biocparallel: Update to 1.14.1.Ricardo Wurmus
* gnu/packages/bioinformatics.scm (r-biocparallel): Update to 1.14.1.
2018-06-02gnu: r-biomart: Update to 2.36.1.Ricardo Wurmus
* gnu/packages/bioinformatics.scm (r-biomart): Update to 2.36.1.
2018-06-02gnu: r-annotationdbi: Update to 1.42.1.Ricardo Wurmus
* gnu/packages/bioinformatics.scm (r-annotationdbi): Update to 1.42.1.
2018-06-02gnu: r-biobase: Update to 2.40.0.Ricardo Wurmus
* gnu/packages/bioinformatics.scm (r-biobase): Update to 2.40.0.
2018-06-02gnu: r-genomicranges: Update to 1.32.3.Ricardo Wurmus
* gnu/packages/bioinformatics.scm (r-genomicranges): Update to 1.32.3.